区别:奥妙一般指隐藏起来，还没有被发现，没有被认识的内容和道理，深奥微妙。强调内容深，着重指微妙的内容和道理。比如，这个玩具奥妙无穷，深受我的喜欢。
奥秘一般的是指神秘深邃，无穷无尽的秘密。着重指神秘的不容易被了解，不被认知的事物，多用于书面语。比如，大自然有无数的奥秘等着我们去发现。
